Хромосомний мікроматричний аналіз (молекулярне каріотипування)

Хромосомний мікроматричний аналіз (ХМА) сьогодні є дослідженням першої лінії при обстеженні дітей з особливостями розвитку, що не вкладаються в однозначну клінічну картину певного поширеного синдрому та в пренатальній діагностиці. Метод дозволяє визначити втрату або надлишок ДНК розміром від 48-72 кb до цілих хромосом. Зміни, які виявляє ХМА, називаються варіації числа копії (copy-number variations або CNVs). Ці зміни є набагато меншими, ніж може виявити каріотипування, максимальна роздільна здатність якого становить 7 Мb. На відміну від каріотипування, ХМА не визначає збалансовані перебудови хромосом, а лише наявність дизбалансу.

ХМА введений в генетичну діагностику у 2003 році, і з того часу описано сотні нових генетичних синдромів, пов’язаних з делеціями (втратами) або дуплікаціями (надлишком) субхромосомного розміру, які не виявляються каріотипуванням і, одночасно з цим, є занадто великими для виявлення стандартними підходами у секвенуванні при аналізі генних захворювань. Такі варіації числа копій можуть бути причиною особливого зовнішнього вигляду дитини, відставання у розвитку, порушеної поведінки, вроджених вад та інших симптомів.

Сучасні мікроматриці складаються з сотен тисяч або млн проб, розподілених з різною щільністю вздовж геному. Щільніше вкриті ділянки, які частіше піддаються перебудовам, внаслідок яких виникає дисбаланс ДНК. Виникнення такого дисбалансу відбувається до запліднення в статевих клітинах не залежить від віку батьків. Крім дрібних порушень, ХМА визначає і повнохромосомні зміни (додаткову чи втрачену хромосому, у тому числі, і в мозаїчному варіанті), тому може замінити каріотипування.

Показаннями для призначення ХМА у дітей є затримка розвитку або інтелектуальна недостатність, вроджені аномалії, дисморфічні ознаки, розлади аутистичного спектру та судоми. ХМА бажано проводити перед призначенням повноекзомного тестування для уникнення хибних результатів.

В пренатальній діагностиці ХМА має бути рекомендований кожній вагітній, яка звернулась з приводу амніоцентезу або біопсії ворсин хоріона. Така рекомендація пов’язана з більшою ефективністю ХМА порівняно з каріотипуванням незалежно від того, чи виявлені особливості розвитку у плода під час УЗД.

Матеріал для дослідження у дітей та дорослих – кров з вени з ЕДТА-К (пробірка 4 мл). При неможливості отриманні зразка крові зв’яжіться з представниками лабораторії «Ультрагеном» для обговорення можливостей виконання тестування з іншого біологічного матеріалу.

В пренатальній діагностиці матеріалом є амніотична рідина (мінімум 20 мл, набрана в шприц без гумової прокладки) або незафіксована суспензія культури амніоцитів у фосфатно-сольовому розчині (PBS). Також, можливе проведення ХМА з інших тканин.

Стандарний термін виконання дослідження – 30 днів.