Онкогенетика
Доказано, что в основе злокачественных новообразований лежит повреждение генетического аппарата в герминальной (половой) и соматической клетках. В зависимости от того, в какой клетке произошла начальная мутация – половая или соматическая, рак может быть наследственным или ненаследственным (спорадическим).
На долю наследственного рака приходится около 10% всех случаев онкологических заболеваний.
Такие виды рака четко ассоциированы с наследованием гена с “поломкой” – патогенной мутацией. Мутируемые гены передаются от родителей к детям и в значительной степени повышают риск развития заболевания.
Каждый человек, носитель наследственной онкогенной мутации, имеет в несколько (а иногда и в сотни) раз более высокие шансы заболеть определенным онкологическим заболеванием.
Известно, что 50% генов в половых клетках (гаметах) человек наследует от отца и 50% от матери, то есть поврежденный ген можно получить от любого родителя . Вероятность передачи дефектного гена по наследству составляет 50%. Такая же возможность наследования мутации существует у братьев и сестер пациента с мутацией. Для более дальних родственников возможность получения мутации уменьшается пропорционально степени родства.
На риск наличия наследственной мутации указывают следующие характеристики:
- факт семейного накопления и «вертикальная» передача заболевания;</li >
- ранний возраст диагностирования заболевания;
- двусторонность или многоочевидность поражения;
- специфические опухолевые ассоциации;
- несколько форм рака у пациента или одного из его родных;
- Наличие патогенной наследственной мутации у близкого родственника.
Если у человека в семье кто-то из кровных родственников болел раком, ему следует узнать, есть ли у него наследственные риски и внимательнее относиться к своему здоровью. Если есть хотя бы один из перечисленных факторов риска, рекомендуется консультация онкогенетика для решения вопроса о необходимости проведения генетического тестирования.
Панель Ultragenom hereditary panel — это расширенная, комплексная панель для определения наследственных рисков практически всех видов рака. Исследование идеально подойдет людям, желающим узнать имеют ли они генетически высокие риски заболеть раком для того, чтобы максимально предупредить заболевание. Зная какая сама мутация присутствует, можно принять эффективные превентивно – профилактические меры, изменившие риск возникновения наследственного рака.
Информация, полученная в результате тестирования, будет важна для кровных родственников человека: в случае обнаружения носительства патогенной мутации им тоже следует провериться, чтобы узнать свой мутационный статус и связанные с ним риски.
Исследование может быть рекомендовано парам, планирующим ЭКО. Они ведь могут использовать возможность предимплантационной генетической диагностики эмбрионов, если знают о наличии у кого-то из будущих родителей патогенной генетической мутации.
От 5 до 10% онкологических заболеваний молочных желез и от 15 до 25% опухолей яичников генетически детерминированы, то есть обусловлены наличием мутаций в генах, связанных с развитием опухоли.
Исследование может быть показано как пациентам с диагностированным раком молочной железы или яичников, так и здоровым женщинам с семейной историей онкологических заболеваний и даже без нее – по желанию пациентки – ведь человек может быть носителем новых мутаций, которых нет у родителей.
Кроме того, наследственная мутация может передаваться от отца или матери даже если у них не проявилось онкологическое заболевание.
Скрининг генов необходим, если:
- Рак молочной железы диагностирован у пациентки в возрасте до 45 лет или до 55 лет (при отягощенном семейном анамнезе);
- Рак найден в обеих железах у одной пациентки;
- У пациентки найден как рак груди так и рак яичников;
- Рак грудной железы у мужчин;
- Рак яичников;
- Если были найдены два или более первичных онкологических заболевания, связанных с наследственными мутациями в генах BRCA у близких родственников и др.
Частый из наследственных онкологических синдромов — синдром рака молочной железы и яичников, в первую очередь обусловлен мутациями в генах BRCA1 и BRCA2, значительно увеличивающих риск развития нескольких типов рака, в частности рака молочной железы и яичников.
Среднестатистический риск развития рака молочной железы (РМЖ) до 80 лет составляет примерно 12%. Мутации в генах BRCA1 и BRCA2 повышают риск развития наследственного РМЖ до 81% и 74% соответственно.
Риск развития рака яичников у женщин – носителей мутации гена BRCA1 составляет около 44%, и 17% при носительстве наследственной мутации гена BRCA2 – то есть в десятки раз выше среднепопуляционного риска в 1,3%.
Для пациентов с онкологическим диагнозом информация о наличии генетических мутаций влияет на вид и объем лечения и поможет определить оптимальный клинический протокол терапии.
При наличии мутаций в генах BRCA1/2 может быть рекомендована таргетная терапия рака новейшими эффективными препаратами группы PARP – ингибиторов.
Эта информация также важна для кровных родственников пациента, которые могли наследовать патогенную поломку гена.
Каждому носителю мутации рекомендуют особый протокол диагностических обследований органов-мишеней, а при определенных мутациях и профилактические операции, минимизирующие риск возникновения нового/повторного рака.
От 5 до 10% онкологических заболеваний молочных желез и от 15 до 25% опухолей яичников являются генетически детерминированными, то есть обусловлены наличием мутаций в генах, связанных с развитием опухоли. span>
Исследование может быть показано как пациентам с диагностированным раком молочной железы или яичников, так и здоровым женщинам с семейной историей онкологических заболеваний и даже без нее — по желанию пациентки — ведь человек может быть носителем новых мутаций, которых нет у родителей.
Помимо этого, наследственная мутация может передаваться от отца или матери даже если у них не проявилось онкологическое заболевание.
В каких случаях скрининг генов необходим:
- Рак молочной железы диагностирован у пациентки в возрасте до 45 лет/55 лет при отягощенном семейном анамнезе;
- Рак найден в обеих железах у одной пациентки;
- У пациентки найден как рак груди так и рак яичников;
- Рак грудной железы у мужчин;
- Рак яичников;
- Если были найдены два или более первичных онкологических заболевания, связанных с наследственными мутациями в генах BRCA у близких родственников и др.
Самый частый из наследственных онкологических синдромов — синдром рака молочной железы и яичников, обусловленный мутациями в генах BRCA1 и BRCA2, которые значительно увеличивают риск развития нескольких типов рака, в частности рака молочной железы и яичников.
Среднестатистический риск развития рака молочной железы (РМЖ) до 80 лет составляет примерно 12%. Мутации в генах BRCA1 и BRCA2 повышают риск развития наследственного РМЖ до 81% и 74% соответственно.
Риск развития рака яичников у женщин – носителей мутации гена BRCA1 составляет около 44%, и 17% при носительстве наследственной мутации гена BRCA2 – то есть в десятки раз выше среднепопуляционного риска в 1,3 %.
Реже причиной возникновения синдрома наследственного рака молочной железы и яичников становятся мутации в генах TP53, PTEN, CDH1, ATM, CHEK2, PALB2 и некоторых других.
Наследственные мутации гена PALB2 связаны с 30-60% риска развития рака молочной железы, а также существенно повышают риски заболеть раком яичника, поджелудочной железы и грудной железы у мужчин.< /span>
Наследственные мутации гена CHEK2 ассоциированы с повышением на 30% риска развития карциномы молочной железы и колоректального рака.
Синдром Ли-Фраумени – ассоциированный с геном TP53 и характеризуется образованием многочисленных опухолей с различными локализациями: рак молочной железы, рак желудка, саркома мягких тканей, опухоли мозга, щитовидной железы эндометрия, меланома и т.д.
Особенностью этих опухолей является раннее развитие заболевания, семейный анамнез и наличие мутации гена TP53. До 50 лет у женщин-носителей мутации в гене TP53 онкологический процесс развивается в 93% случаев, при этом средний возраст развития рака у женщин составляет 29 лет. Приблизительно в 20% случаев синдром Ли-Фраумени является результатом мутации de novo, то есть спонтанной первичной мутации в одной из половых клеток родителей. В такой ситуации отягощение семейного анамнеза отсутствует.
Синдром Коудена – мутация в гене PTEN, вероятность развития доброкачественной опухоли – 65 %, злокачественной – 25-50 %. Для этого синдрома также характерны поражения слизистых (99%), полипы кишечника (60-90%), немедуллярный рак щитовидной железы, рак эндометрия, карцинома почек.
Синдром Пейтца-Эгерса, ассоциированный с геном STK11 и повышает риск опухоли груди до 50% и яичников до 20%.
Встречается также онкологическая ассоциация наследственного рака молочной железы и рака желудка, возникающая при мутации гена CDH1. Этот ген принимает участие в поддержке эпителиальной структуры клеток.
Мутация CDH1 связана с диффузным раком желудка (риск 50-80%), а также с дольчатым раком молочной железы, риск возникновения которого у женщины будет около 40%. В общем, при мутации CDH1 комбинированный риск развития синхронного и метахронного рака молочной железы и рака желудка у женщин составляет около 80%. У носителей мутации повышен также риск колоректального рака.
Для пациентов с онкологическим диагнозом информация о наличии генетических мутаций влияет на вид и объем лечения и поможет вопределить оптимальный клинический протокол терапии.
При наличии мутаций в генах BRCA1/2 и PALB2 может быть рекомендована таргетная терапия рака новейшими эффективными препаратами из группы PARP – ингибиторов.
Эта информация также очень важна для кровных родственников пациента, которые могли наследовать патогенную поломку гена.
Каждому носителю мутации рекомендуют особый протокол диагностических обследований органов-мишеней, а при определенных мутациях и профилактические операции, минимизирующие риск возникновения нового/повторного рака.
Соматические мутации – это мутации генов в клетках солидных опухолей, то есть они могут быть обнаружены только при тестировании материала опухоли и являются приобретенными, а не наследственными.
Для тестирования пригоден любой гистологический материал пациента – операционные блоки и стеклышки, полученные менее 5 лет назад, при этом более свежий гистологический биоптат более предпочтителен для исследования по сравнению с архивным материалом.< /span>
Направленный в лабораторию гистологический материал сначала проверяется на пригодность для тестирования – он должен содержать достаточное количество опухолевой ткани для получения подходящей для анализа ДНК.
Ultramarine hotspot panel используют для выявления генетических факторов, влияющих на течение и прогноз онкологического заболевания, определения тактики и повышения эффективности его лечения.
Обнаружение соматических мутаций может помочь подобрать наиболее эффективную терапию индивидуально для каждого пациента с учетом генетических особенностей его опухоли.
Тестирование показано:
- пациентам с диагностированным раком, для которого существует несколько вариантов таргетной терапии (например, рак легкого , колоректальный рак);
- пациентам с диагностированным раком, которым не помогает терапия, назначена на основании стандартных клинических протоколов;
- пациентам с диагностированным раком, для которого не существует клинических стандартов лечения.
Обнаружение мутаций в генах опухолевой ткани позволяет назначить корректную схему лечения при раке молочной железы, яичниках, немелкоклеточном раке легких, колоректальном раке, меланоме, раке предстательной железы, других злокачественных новообразований.
Конечная цель исследования – полная информация о наличии мутаций, ассоциированных с ответом на таргетную терапию.
Генетическое тестирование опухоли с помощью Ultramarine hotspot panel позволяет врачу персонализировать лечение и получить результат лучше, чем при стандартном лечении.
Именно благодаря методу NGS возможно протестировать сразу тысячи мутаций в десятках генов на одном образце ткани.
К тому же, с Ultramarine hotspot panel мы выигрываем время, которое бесценно для онкопациента.
В заключении будет перечень выявленных клинически значимых мутаций с их описанием и перечень таргетных препаратов, ответ на которые ассоциирован с выявленными мутациями при том или ином типе рака.
Результат исследования предоставляется вместе с клинической интерпретацией онкогенетика, и содержит перечень выявленных клинически значимых мутаций с их описанием и указанием таргетных препаратов, ответ на которые ассоциирован с найденными мутациями.
Перечень исследуемых генов (ДНК): ABL1, EGFR, GNAS, KRAS, PTPN11, AKT1, ERBB2, GNAQ, MET, RB1, ALK, ERBB4, HNF1A, MLH1, RET, APC, EZH2, HRAS, MPL, SMAD4, ATM, FBXW7, IDH1, NOTCH1, SMARCB1, BRAF, FGFR1, JAK2, NPM1, SMO, CDH1, FGFR2, JAK3, NRAS, SRC, CDKN2A, FGFR3, IDH2, PD CSF1R, FLT3, KDR, PIK3CA, TP53, CTNNB1, GNA11, KIT, PTEN, VHL, NRAS, CKIT.
Материал для исследования – гистологические блоки/стекла.
Его результаты помогут подобрать наиболее эффективную терапию индивидуально для каждого пациента с учетом генетических особенностей его опухоли.
Ultramarine Oncomine plus panel панель является геномным профилированием опухолей, включающим определение:
- одногенных биомаркеров – широкий диапазон одногенных вариантов, таких как однонуклеотидные варианты (SNV), инсерции и делеции (inDels), новые и известные транслокации, варианты сплайсинга и варианты числа копий (амплификации, CNV) и т.д.;
- мультигенных биомаркеров – мутационная нагрузка опухоли (TMB), микросателлитная нестабильность (MSI) и анализ мутационных сигнатур для понимания этиологических факторов онкогенеза;
- дефицита репарации гомологической рекомбинации – HRD – для оценки геномной нестабильности и мутаций в 42 ключевых генах пути репарации гомологической рекомбинации (HRR).
При этом важно отметить, что количество ткани не является проблемой для данного исследования. Даже небольшие биопсии и аспираты толстоиголочной биопсии могут быть успешно исследованы благодаря Ultramarine Oncomine plus panel.
| Одногенные биомаркеры | Многогенные биомаркеры |
165 генов на мутации (SNV, In/Dels) в “горячих точках”< /td> | HRD – Определение LOH (потери гетерозиготности) — на уровне гена и уровне образца</ td> |
| 333 генов на амплификации и делеции (CNV) | Анализ и визуализация мутационных сигналов |
| 227 генов с полной кодирующей последовательностью ДНК (CDS) | >1 mb кодирующих последовательностей для определения TMB (мутационной нагрузки опухоли)</td > |
| 49 генов на транслокации (Fusions) | Микросателитные маркеры MSI-H/MSS для определения статуса MSI |
| MET обнаружение пропусков экзонов на уровне ДНК и РНК |
Материал для исследования: гистологические (парафиновые) блоки

