Хромосомный микроматричний анализ

Хромосомный микроматричний анализ (ХМА) сегодня является исследованием первой линии при обследовании детей с особенностями развития, которые не укладываются в однозначную клиническую картину определенного распространенного синдрома и в пренатальной диагностике. Метод позволяет определить потерю или избыток ДНК размером от 48-72 кb до целых хромосом. Изменения, которые обнаруживает ХМА, называются вариации числа копии (copy-number variations или CNVs). Эти изменения намного меньше, чем может обнаружить кариотипирование, максимальное разрешение которого составляет 7 Мb. В отличие от кариотипирование, ХМА не определяет сбалансированные перестройки хромосом, а лишь наличие дисбаланса.

ХМА введен в генетическую диагностику в 2003 году, и с тех пор описано сотни новых генетических синдромов, связанных с делециями (потерями) или дупликации (избытком) субхромосомного размера, которые не обнаруживаются кариотипированием и, одновременно с этим, являются слишком большими для выявления стандартными подходами в секвенировании при анализе генных заболеваний. Такие вариации числа копий могут быть причиной особого внешнего вида ребенка, отставание в развитии, возбужденного поведения, врожденных пороков и других симптомов.

Современные микроматрици состоят из сотен тысяч или миллионов проб, распределенных с разной плотностью вдоль генома. Плотнее покрытые участки, чаще подвергаются перестройкам, в результате которых возникает дисбаланс ДНК. Возникновение такого дисбаланса происходит к оплодотворению в половых клетках не зависит от возраста родителей. Кроме мелких нарушений, ХМА определяет и повнохромосомни изменения (дополнительную или потерянную хромосому, в том числе, и в мозаичном варианте), поэтому может заменить кариотипирование.

Показаниями для назначения ХМА у детей является задержка развития или интеллектуальная недостаточность, врожденные аномалии, дисморфични признаки, расстройства аутистического спектра и судороги. ХМА желательно проводить перед назначением повноекзомного тестирования во избежание ложных результатов.

В пренатальной диагностике ХМА должен быть рекомендован каждой беременной, которая обратилась по поводу амниоцентеза или биопсии ворсин хориона. Такая рекомендация связана с большей эффективностью ХМА сравнению с кариотипированием независимо от того, выявлены особенности развития у плода во время УЗИ.

Материал для исследования у детей и взрослых — кровь из вены с ЭДТА-К (пробирка 4 мл). При невозможности получении образца крови свяжитесь с представителями лаборатории «Ультрагеном» для обсуждения возможностей выполнения тестирования с другого биологического материала.

В пренатальной диагностике материалом является амниотическая жидкость (минимум 20 мл, набранная в шприц без резиновой прокладки) или незафиксированная суспензия культуры амниоциты в фосфатно-солевом растворе (PBS). Также, возможно проведение ХМА из других тканей.

Стандарный срок выполнения исследования — 30 дней.